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學(xué)術(shù)交流

【學(xué)術(shù)報(bào)告】生態(tài)環(huán)境學(xué)院學(xué)術(shù)報(bào)告通知

發(fā)布時(shí)間:2019年12月17日 來(lái)源:生態(tài)環(huán)境學(xué)院 點(diǎn)擊數(shù):

報(bào)告一:

報(bào)告題目:蛋白質(zhì)組大數(shù)據(jù)和人工智能的臨床應(yīng)用

報(bào)告人:郭天南研究員

報(bào)告時(shí)間:2019年12月18日(周三)下午14:00

報(bào)告地點(diǎn):數(shù)字化大樓A座303會(huì)議室

報(bào)告摘要:

近年來(lái),多項(xiàng)技術(shù)創(chuàng)新推動(dòng)蛋白質(zhì)組學(xué)經(jīng)歷著深刻的變革。蛋白質(zhì)組分析的通量在近5年提高了10倍以上,所需的樣本量降低了10倍以上,單個(gè)蛋白質(zhì)組實(shí)驗(yàn)包含的樣本數(shù)量達(dá)到百和千的級(jí)別,每個(gè)樣本中被檢測(cè)到的蛋白質(zhì)數(shù)量也增加了至少2倍。高通量蛋白質(zhì)組技術(shù)的進(jìn)步驅(qū)動(dòng)了越來(lái)越多的臨床樣本的蛋白質(zhì)組被檢測(cè),并與其基因組和轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行綜合分析,以期對(duì)疾病診療的更為精準(zhǔn)的指導(dǎo)。這里,我會(huì)跟大家具體探討蛋白質(zhì)組大數(shù)據(jù)的方法學(xué)進(jìn)展以及其結(jié)合人工智能,在醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用。


個(gè)人簡(jiǎn)介:

郭天南,西湖大學(xué)特聘研究員。主要研究方向蛋白質(zhì)組大數(shù)據(jù)。郵箱:[email protected]。2006年畢業(yè)于華中科技大學(xué)同濟(jì)醫(yī)學(xué)院臨床醫(yī)學(xué)七年制,同時(shí)獲得武漢大學(xué)生物科學(xué)雙學(xué)位。2012年獲得新加坡南洋理工大學(xué)博士學(xué)位。2012-2017年在瑞士蘇黎世聯(lián)邦理工大學(xué)Ruedi Aebersold教授實(shí)驗(yàn)室從事博士后研究。2017年初在澳大利亞悉尼大學(xué)兒童醫(yī)學(xué)研究所ProCan任Scientific Director,腫瘤蛋白質(zhì)組Group Leader,悉尼大學(xué)醫(yī)學(xué)院兼聘高級(jí)講師。2017年8月加入西湖高等研究院任特聘研究員。長(zhǎng)期從事蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)研究,在蛋白質(zhì)組技術(shù)開(kāi)發(fā)和臨床應(yīng)用上做出多項(xiàng)原創(chuàng)性技術(shù)成果。建立了一套獨(dú)特的高通量臨床蛋白質(zhì)組方法學(xué)(高壓循環(huán)-衛(wèi)星掃描質(zhì)譜技術(shù),PCT-SWATH),解決了將蛋白質(zhì)組學(xué)實(shí)際應(yīng)用于醫(yī)學(xué)臨床檢驗(yàn)的一個(gè)核心技術(shù)難題,實(shí)現(xiàn)了對(duì)小量臨床樣本的高重復(fù)性高通量的質(zhì)譜分析,并將其應(yīng)用于大量的臨床樣本(包括甲狀腺癌、前列腺癌、腎癌等),結(jié)合人工智能探索生物標(biāo)志物。近5年以第一作者或通訊作者在Nature Medicine,Nature Comm,Mol Oncology等發(fā)表多篇論文。更多信息請(qǐng)參考www.guomics.com。

報(bào)告二:

報(bào)告題目:單細(xì)胞技術(shù)解析渦蟲(chóng)再生的細(xì)胞及分子機(jī)制

報(bào)告人:曾安研究員

報(bào)告時(shí)間:2019年12月18日(周三)下午14:00

報(bào)告地點(diǎn):數(shù)字化大樓A座303會(huì)議室

報(bào)告摘要:

探究如何讓衰老或損傷的機(jī)體再生出新的功能性組織或細(xì)胞是發(fā)育生物學(xué)和再生醫(yī)學(xué)中的重要問(wèn)題。為了研究再生的生物學(xué)機(jī)制,我們選擇淡水渦蟲(chóng)(Planarian)作為研究模型。渦蟲(chóng)具有強(qiáng)大的再生能力,其身體任意片段被切割后,都能再生出完整的個(gè)體。長(zhǎng)期以來(lái),維持渦蟲(chóng)無(wú)限再生能力的細(xì)胞類(lèi)型并不清楚。我們前期工作結(jié)合基因組學(xué)、單細(xì)胞分析、流式細(xì)胞術(shù)和成像技術(shù),鑒定并分離了渦蟲(chóng)無(wú)限再生能力的細(xì)胞來(lái)源--成體存在的一群多能性干細(xì)胞。我們發(fā)現(xiàn),這群干細(xì)胞可以在單細(xì)胞移植實(shí)驗(yàn)中分化形成所有其他細(xì)胞類(lèi)型,并重建整個(gè)渦蟲(chóng)。這個(gè)發(fā)現(xiàn)更新了領(lǐng)域內(nèi)對(duì)渦蟲(chóng)干細(xì)胞組成和身份的認(rèn)知,揭示了渦蟲(chóng)無(wú)限再生能力的細(xì)胞學(xué)基礎(chǔ)。這個(gè)發(fā)現(xiàn)可能促進(jìn)對(duì)渦蟲(chóng)等具有較強(qiáng)再生能力的有機(jī)體開(kāi)展生物研究,而且有助于對(duì)人類(lèi)等具有較低再生能力的有機(jī)體開(kāi)展再生醫(yī)學(xué)研究。

個(gè)人簡(jiǎn)介:

曾安,中國(guó)科學(xué)院生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所研究員。研究興趣:組織器官再生。

2013年博士畢業(yè)于中科院上海生科院。2013年至2019年于美國(guó)斯托瓦斯醫(yī)學(xué)研究所(Stowers Institute)任博士后研究員,導(dǎo)師為美國(guó)科學(xué)院院士、HHMI研究員Alejandro Sánchez Alvarado教授。自2006年起在國(guó)內(nèi)建立地中海渦蟲(chóng)(Schmidtea mediterranea)研究體系用于組織器官再生的機(jī)制研究。主要研究方向是利用渦蟲(chóng)(planarian)等為模式生物,研究組織器官再生的細(xì)胞及分子學(xué)基礎(chǔ)。主要研究貢獻(xiàn):1)揭示組織干細(xì)胞參與渦蟲(chóng)再生的表觀(guān)遺傳學(xué)調(diào)控機(jī)理(2013,JCB); 2)利用大規(guī)模單細(xì)胞基因表達(dá)分析技術(shù),結(jié)合單細(xì)胞分選、單細(xì)胞移植等實(shí)驗(yàn)手段,揭示了渦蟲(chóng)無(wú)限再生能力的細(xì)胞起源(2018,Cell)。曾獲得2013年中國(guó)科學(xué)院院長(zhǎng)獎(jiǎng)優(yōu)秀獎(jiǎng),2012年美國(guó)Keystone Symposia會(huì)議Future of Science Fund獎(jiǎng)學(xué)金等。